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5hmC全基因组高通量检测:肝病病人新“保险”

http://www.med.hc360.com2018年10月12日17:26 来源:医药网T|T

为了普及肝病防治知识、提高肝病诊疗水平、促进肝病学科发展,并为安徽省青年医师们对于肝脏疾病的诊疗水平的提高提供更丰富的交流平台,蚌埠医学院第一附属医院于2018年9月28日-9月29日在安徽蚌埠牵头召开举办了“安徽省肝病学会青年论坛暨疑难病例评比大赛”。

 

本次会议围绕病毒性肝炎、脂肪性肝病、酒精性肝病、肝衰竭及人工肝、肝纤维化、肝癌、药物性肝病以及相关肝脏疾病等各个方面的临床与基础医学的预防、诊断、治疗及新进展。同时,本次会议中强调了肝癌早期筛查的重要性探讨了辅助诊断方法的可行性,上海易毕恩基因科技有限公司的全球独家专利技术——5hmC全基因组高通量检测技术,为肝癌超早期筛查带了新的可能性。

 

赵守松教授致开幕词

众所周知,肝癌的早发现、早诊断很重要,因为肝癌的症状在早期很不明显,一般就诊时就已到中晚期,甚至已向肺部等处转移。目前运用传统检测手法,有40%的早期患者无法被检测出肝癌,这也成为影响我国肝癌死亡率居高不下的重要原因。

人类基因组计划(human genome project,HGP)基本完成后,研究基因的表达调控成为了解肿瘤发生机制的关键问题之一。近年来,研究发现基因的表达不仅取决于基因本身,还取决于不改变基因序列的表观遗传修饰(Epigenetic Modification)。表观遗传修饰对于肿瘤的发生、诊断和治疗等具有重要意义。异常的表观遗传修饰会使基因错误地表达,引起代谢紊乱和疾病甚至肿瘤的发生。5-羟甲基胞嘧啶(5hmC) 是一种重要的表观遗传修饰,作为DNA甲基化动态调控过程中的重要中间产物,较甲基化更能动态灵敏地反映癌症相关的基因表达状态。 

2015年,液体活检技术被MIT Technology Review杂志评为全球年度十大突破技术之一。5hmC的分布具有组织特异性,并且在正常组织和肿瘤组织中均可观察到,其敏感的总量变化经各类肿瘤反复验证,已证实5hmC可用于肿瘤辅助诊断,目前通过液体活检的技术即通过血液cfDNA的5hmC检测,找出癌症与非癌的差异,从而对肿瘤进行辅助诊断。 

 

易毕恩医学经理在会上向参会专家详细分享了用于肝癌筛查和辅助诊断的新一代液体活检技术——全基因组5hmC高通量检测的背景、核心技术、临床研究成果及应用

易毕恩的富集羟甲基化片段的专利技术(5hmC全基因组高通量测序技术)能够特异捕获血液cfDNA中含5hmC修饰的基因片段,并且由于该技术为独有的化学标记技术,可获得全基因组大约2万个含有5hmC的基因片段。同时采用最新一代Illumina高通量测序仪进行二代测序,便能获得5hmC在全基因组的含量分布谱。通过大数据分析比较健康人和肝癌患者的全基因组5hmC含量分布图谱,建立肝癌5hmC预测模型,便能够实现肝癌的早期检测。 

初期的研究使用了来自于上海中山医院(60%)、东方肝胆医院(35%)和华山医院(5%)的近4000例临床样本,多中心临床研究确保了结果稳定可靠。通过这近4000例的临床样本,得出了研究结论:5hmC在全基因组的含量分布差异可以区分肝癌和非肝癌,对肝细胞肝癌诊断的灵敏度达90%,特异度达94%。肝癌5hmC高通量检测独立应用时准确度优于AFP,可实现较现有血液学检测技术更好的肝癌早期筛查和辅助诊断。 

5hmC检测技术应用于肝癌检测的准确率:灵敏度:90%特异性:94%

 

 

肝癌5hmC高通量检测独立应用时准确度优于AFP检测,可实现较之现有诊断技术准确率更高的辅助诊断。

 

易毕恩全球独家专利的5hmC全基因组高通量检测主要有两大优势。其一,5hmC化学标记检测技术更稳定更灵敏。与DNA甲基化检测相比,5hmC化学标记检测技术更稳定更灵敏;与循环肿瘤细胞(CTC)检测相比,5hmC检测可以在更早期阶段检测出癌症;与癌症易感基因突变检测相比,5hmC检测反映身体实时的癌症与健康状态。其二,数据分析更全面更科学。全基因组捕获测序和多基因位点共同建模使获取的信息更全面;多中心临床研究和大样本量使结果更可靠;样本分组,独立验证,避免过拟合,使得结果更加稳定。 

基于表观遗传在肿瘤早期筛查方面的特性,5hmC全基因组高通量检测专利技术的发明,为解决早期肝癌隐匿且难以确诊的问题,带来了新的可能。这一检测技术用于临床,不仅将能提高肝癌的早期诊断率,还能早期监测术后的复发和转移。 

全球独家专利技术5hmC全基因组高通量检测技术在临床上的应用,成功在常规检查手段无法确诊早期肝癌的情况下检测出了肝癌的早期信号,实现了早发现、早治疗,相比较于晚期肝癌的发现治疗,在治疗经费和治疗效果上都获得巨大收益。

拓展阅读——赵守松教授

赵守松教授

 

蚌埠医学院第一附属医院感染病科主任、教授、硕士研究生导师;安徽省第二届“江淮名医”;中国研究型医院学会感染病专业委员会常委;中华医学会肝病学会全国委员;全国肝衰与人工肝专家委员会委员;安徽省肝病学会主任委员;蚌埠市肝病学会主任委员;毫州市肝病学会与感染病学会名誉主任委员;任《中华肝脏病学杂志》、《实用肝脏病杂志》、《临床肝胆病杂志》、《微生物与感染》、《蚌埠医学院学报》等杂志的编委。

擅长各种肝病(病毒性肝炎、肝硬化、肝癌、脂肪肝、自身免疫性肝病等)、感染性疾病(各种局部感染、全身感染的治疗包括抗生素的合理使用等)、各种不明原因的发热性疾病的诊治。 

责任编辑:周玲玲

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