高建民课题组的《报告》显示，“三级医院成本系数平均值（指总的支出与总收入的比）为0.9707，也就是说三级医院在总收入1元的情况下，支出为0.9707元，有0.03元结余”。同时，“三级医院医疗成本系数为1.2646，也就是说医疗成本支出1.2646元，其收入为1元。而扣除财政拨款的医疗成本系数三级医院为1.4517，也就是说扣除财政补贴外其医疗成本支出1.4517元，能收回1元的成本”。从经营情况看，当年24所医院经营都有结余，其中三级医院收入超过1.1亿元，平均结余347万元;二级医院收入1700万元，结余18万元;一级医院结余8万元，专科医院结余255万元。这说明目前医院经营都有盈利。这也证明了“药品收入不仅弥补了医院医疗收费的亏损，而且还带来了盈利”。

　　《报告》中清楚计算了“医疗服务成本”的基本构成，即人员费用、临时工费、公务费、业务费等9项，其中“人头费”（人员费用、临时工费）占到总成本的41%～54%，成为医疗服务成本的“大头”。而且随着医院级别的降低，人员费用越高，如三、二、一级医院分别为40.07%、46.5%、50.8%。高建民认为，这个比例足以说明，“行政后勤等非医疗一线部门的结构比例，是在一个合理的范围之内”。丁会文院长的计算，是“一般的三甲医院，都明确要求医务人员的比例必须达到75%以上，其中，医护比例大约为1∶2或1∶1.25，行政和后勤人员的比例均为10%左右，这个结构是不存在太大问题的，和一般企业中存在的机构庞杂臃肿问题完全不一样，不能用‘负担’来形容”。结构上的压力，主要来自离退休人员，丁会文说，他们所占到的比例，“一般介于1/4与1/3之间”。大医院因为历史的原因和人员数量，在这个方面的压力显然比小医院大很多。但高建民提醒记者注意的，是在他的测算中，“各级医院的固定资产业务收入相当可观，每100元固定资产，年收益达99元，可以说效益非常好”。

　　从高建民的分析中不难发现，即便有着如此清晰的数据，医院的成本计算，盈亏统筹依旧是一个很微妙的问题。这一点丁会文说得耐人寻味，“三甲医院账面上有时候甚至必须是赤字”。而一位业内人士则有这样的解释，“非营利的公立医院首先在财政拨款上不足，定价体系上又存在无法按照成本收费的弊病，加上内部管理和离退休人员压力，要是账面上利润很高，不是摆明说自己的药价和医疗设备上的灰色利润有多惊人吗？”

　　显然，政府财政补贴减少成为大医院功能“变异”的导火索。共同作用的还有定价机制，医疗服务的定价权属于省一级卫生管理部门和物价部门，“目前医疗价格基本是管死的，而且看来现行价格管制已经很不合理、很扭曲了。”北京大学中国经济研究中心周其仁教授说。这直接导致了医院通过“灰色收入”得到价格补差，医院收入主要从药品、器械上来，还允许医生完成本职工作外“走穴”，到市场上去挣钱。这样，公立医院越来越背离当初设立时的方向，“一些公立医院更像是营利性的私人公司，医院和医生考虑更多的是赚钱和赢利，完全背离了当初设立公立医院的初衷。”卫生部卫生经济研究所卫生政策研究室主任石光说。