其前身是1936年成立的江苏省立医政学院附设诊疗所。
医院目前是江苏省规模最大的综合性医院，担负着全省医疗、教学和科研三项中心任务。
医院占地6.8万M2，约102.5亩；现有建筑面积13.11万 M2，其中医疗业务用房12.53万M2。医院固定资产总额6.36亿元，其中医疗设备2.73亿元。
医院设病床1650张，年门急诊量151.7万人次，年住院28177人次。
医院临床医技科室设置齐全，重点科室技术特色显著。有3个省级重点学科,分别是内科、普外科、皮肤性病科；省级“135”重点学科15个，分别是心血管内科、内分泌科、呼吸内科、消化内科、肾脏内科、老年医学科、普外科、肝脏外科、泌尿外科、皮肤与性病学科、感染病科、耳科学与听力学科、临床生殖医学、麻醉科、临床生物学诊断与治疗实验室；省级重点临床专科21个。省级医疗诊治中心3个，分别是江苏省心脏介入中心、江苏省肝脏移植中心、江苏省急诊医学中心。 医院现有7个二级学科博士点，覆盖20个三级学科；17个二级学科硕士点，覆盖30个三级学科，是临床医学博士后科研流动站，临床医学博士、硕士学位授予点。南京医科大学第一临床医学院就设在医院内，共有21个教研室，3个教学组，担负着南京医科大学的临床教学和实习任务。
医院现有9个研究所，17个研究室。是国家药品临床研究基地，省心肌病定向科研基地，全国首批获准开展人类精子库和辅助生育技术的单位。
2003年度新获各类科研项目127项；新获科技成果奖26项；发表学术论文1066篇，其中SCI论文数全国医院排名第16名；获科研项目经费700万元，新获学科、人才建设经费1340万元。
医院现有职工2004人，其中医技人员1524人，医技人员中高级职称385人，中级职称684人，现有博士生导师43人，硕士生导师144人。
医院对外交流活跃，与美国、日本、加拿大、澳大利亚及意大利等国的医院、学科和实验室建立了友好合作关系。
医院注重精神文明建设，先后多次被评为卫生部卫生先进集体，多次被评为江苏省省级文明单位、江苏省和南京市“十佳”医院。
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